{"id":1475,"date":"2020-05-28T15:48:36","date_gmt":"2020-05-28T13:48:36","guid":{"rendered":"https:\/\/www.institut-cognition.com\/?p=1475"},"modified":"2020-05-28T15:48:36","modified_gmt":"2020-05-28T13:48:36","slug":"questions-a-nicolas-vayatis-directeur-du-centre-borelli-au-sujet-de-la-crise-sanitaire-du-covid-19","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.institut-cognition.com\/en\/2020\/05\/28\/questions-a-nicolas-vayatis-directeur-du-centre-borelli-au-sujet-de-la-crise-sanitaire-du-covid-19\/","title":{"rendered":"Questions \u00e0 Nicolas Vayatis, Directeur du Centre Borelli, au sujet de la crise sanitaire du COVID-19"},"content":{"rendered":"<p><img fetchpriority=\"high\" decoding=\"async\" class=\"wp-image-1497 size-medium alignleft\" src=\"https:\/\/www.institut-cognition.com\/wp-content\/uploads\/2020\/04\/c-borelli-2-300x300.jpg\" alt=\"\" width=\"300\" height=\"300\" srcset=\"https:\/\/www.institut-cognition.com\/wp-content\/uploads\/2020\/04\/c-borelli-2-300x300.jpg 300w, https:\/\/www.institut-cognition.com\/wp-content\/uploads\/2020\/04\/c-borelli-2-150x150.jpg 150w, https:\/\/www.institut-cognition.com\/wp-content\/uploads\/2020\/04\/c-borelli-2.jpg 423w\" sizes=\"(max-width: 300px) 100vw, 300px\" \/>Le Centre Borelli est membre de l\u2019Institut Cognition depuis f\u00e9vrier 2020.<br \/>\nL\u2019Institut Cognition regroupe 22 Unit\u00e9s de Recherche publiques et a obtenu le label Carnot lors du 4\u00e8me Appel de l\u2019ANR.<br \/>\nLes \u00e9quipes de l\u2019Institut Cognition sont mobilis\u00e9es depuis la crise sanitaire du COVID-19 pour r\u00e9pondre de fa\u00e7on r\u00e9active et interdisciplinaire aux enjeux cognitifs d\u2019une telle situation.<\/p>\n<h5><strong>Pouvez-vous nous pr\u00e9senter le Centre Borelli ?<\/strong><\/h5>\n<p><strong>Nicolas Vayatis<\/strong> : Le <strong><em>Centre Borelli<\/em><\/strong> est un Laboratoire interdisciplinaire de recherche r\u00e9unissant des chercheurs en math\u00e9matiques, en informatique et en neurosciences tr\u00e8s investis dans le transfert de technologies num\u00e9riques vers l\u2019industrie ou le secteur biom\u00e9dical. Il r\u00e9sulte de la fusion du <strong><em>Centre de Math\u00e9matiques et de Leurs Applications<\/em><\/strong> (CMLA &#8211; UMR 8536, cr\u00e9\u00e9 en 1990) avec l\u2019unit\u00e9<strong><em> Cognition and Action Group<\/em><\/strong> (COGNAC G \u2013 UMR 8257, cr\u00e9\u00e9 en 2015). Les tutelles du Centre Borelli sont l\u2019ENS Paris-Saclay, le CNRS (INSMI, INSB et INS2I), l\u2019Universit\u00e9 de Paris (regroupement de Paris V et Paris VII), le Service de Sant\u00e9 des Arm\u00e9es et l\u2019INSERM.<\/p>\n<p>Les principaux axes de recherche du Centre Borelli, en interaction constante, sont les suivants :<\/p>\n<p>I. La mod\u00e9lisation et la simulation de ph\u00e9nom\u00e8nes physiques et biologiques complexes,<br \/>\nII. Les math\u00e9matiques et algorithmes pour l\u2019apprentissage et la perception artificiels,<br \/>\nIII. Les neurosciences comportementales chez la personne humaine et l\u2019animal.<\/p>\n<p>L\u2019effort de recherche men\u00e9 au Centre Borelli et l\u2019expertise qui y est cultiv\u00e9e sont dans la continuit\u00e9 des activit\u00e9s du CMLA et de COGNAC G. Ils sont notamment caract\u00e9ris\u00e9s par une approche globalisante et pragmatique comprenant un socle th\u00e9orique, une intimit\u00e9 avec la r\u00e9alit\u00e9 des ph\u00e9nom\u00e8nes \u00e9tudi\u00e9s (campagnes de mesures in situ, expertise transdisciplinaire) et une concr\u00e9tisation des r\u00e9alisations au travers des technologies num\u00e9riques (codes num\u00e9riques industriels, plateformes internet\u2026).<\/p>\n<p><img decoding=\"async\" class=\"alignright size-full wp-image-1521\" src=\"https:\/\/www.institut-cognition.com\/wp-content\/uploads\/2020\/04\/illust-vaya.jpg\" alt=\"\" width=\"1294\" height=\"324\" srcset=\"https:\/\/www.institut-cognition.com\/wp-content\/uploads\/2020\/04\/illust-vaya.jpg 1294w, https:\/\/www.institut-cognition.com\/wp-content\/uploads\/2020\/04\/illust-vaya-300x75.jpg 300w, https:\/\/www.institut-cognition.com\/wp-content\/uploads\/2020\/04\/illust-vaya-1024x256.jpg 1024w, https:\/\/www.institut-cognition.com\/wp-content\/uploads\/2020\/04\/illust-vaya-768x192.jpg 768w\" sizes=\"(max-width: 1294px) 100vw, 1294px\" \/><\/p>\n<h5><strong>Comment \u00eates-vous organis\u00e9s depuis le d\u00e9but du confinement\u00a0?<\/strong><\/h5>\n<p><strong>N. V.\u00a0: <\/strong>Nous avons d\u00e9cid\u00e9 de fermer nos locaux le dimanche 15 mars. Notre cellule administrative disposait d\u00e9j\u00e0 d\u2019une organisation apte au t\u00e9l\u00e9travail gr\u00e2ce notamment \u00e0 un dispositif de fichiers partag\u00e9s. Ainsi, il y a une continuit\u00e9 de service garantie, on ne voit pas trop de diff\u00e9rence dans la gestion des affaires courantes. Un point d\u00e9licat est la livraison de mat\u00e9riels informatiques qui est rapidement devenue impossible ce qui pose des difficult\u00e9s \u00e0 certains de nos coll\u00e8gues. Par ailleurs, pour nos chercheurs investis dans l\u2019exp\u00e9rimentation en neurosciences comportementales, il y a une partie de leur activit\u00e9 qui est rendue impossible et ils assurent simplement des actions ponctuelles de \u2018maintenance\u2019 sur site. La vie du laboratoire est bien entendu tr\u00e8s affect\u00e9e mais il y a une certaine intensit\u00e9 d\u2019\u00e9changes pour les chercheurs impliqu\u00e9s dans les questions de mod\u00e9lisation, simulation, traitement de donn\u00e9es et pr\u00e9visions statistiques. Ainsi, pour un certain nombre d\u2019actions, nous avons mis en place des outils comme Trello, Slack, Google group. Par ailleurs, certains groupes de travail ont maintenu leurs sessions sous forme de webinaires avec des taux de participation particuli\u00e8rement \u00e9lev\u00e9s<em>.<\/em><\/p>\n<h5><strong>Comment sont mobilis\u00e9s vos chercheurs au sujet de cette crise du COVID-19\u00a0?<\/strong><\/h5>\n<p><em>\u00a0<\/em><strong>N.V.\u00a0 : <\/strong>En comptant parmi nos membres des praticiens hospitaliers se trouvant aux avant-postes avant l\u2019arriv\u00e9e de la vague de patients avec des insuffisances respiratoires aig\u00fces, nous nous sommes particuli\u00e8rement sensibilis\u00e9s au sujet avant m\u00eame que le Covid-19 via le confinement ou l\u2019atteinte de connaissances ou de proches ne touche chacun d\u2019entre nous de mani\u00e8re directe. Ils ont ainsi formul\u00e9 certains besoins en termes de traitement de donn\u00e9es, d\u2019aide \u00e0 la d\u00e9cision. N\u2019\u00e9tant pas experts du sujet, nous avons n\u00e9anmoins lanc\u00e9 un appel aux volontaires le 15 mars auxquels ont r\u00e9pondu une trentaine de personnes. Diff\u00e9rents groupes se sont form\u00e9s et pour certains, ont montr\u00e9 dynamisme, motivation, et intensit\u00e9 \u00e0 des niveaux tr\u00e8s \u00e9lev\u00e9s. Parmi les th\u00e8mes qui ont \u00e9t\u00e9 investis, on trouve\u00a0: les mod\u00e8les pr\u00e9dictifs macro bas\u00e9s sur la pr\u00e9vision statistique (\u00e9chelle pays\/r\u00e9gion), la mod\u00e9lisation et la simulation des ph\u00e9nom\u00e8nes \u00e9pid\u00e9miques avec une \u00e9valuation des strat\u00e9gies dynamiques d\u2019allocations de ressources, le traitement de donn\u00e9es en vue du monitoring en continu des patients dans les unit\u00e9s de soins intensifs, le suivi de la sant\u00e9 psychique en rapport avec le confinement\u2026<\/p>\n<h5><strong>Quels sont les diff\u00e9rents travaux en cours concernant cette crise\u00a0?<\/strong><\/h5>\n<p><em>\u00a0<\/em><strong>N.V.\u00a0 : <\/strong>Les diff\u00e9rents groupes ont formalis\u00e9 les probl\u00e9matiques et lanc\u00e9 des projets associ\u00e9s\u00a0:<em>\u00a0<\/em><\/p>\n<p><em><strong>I. Mod\u00e8les pr\u00e9dictifs macro de la date et de la hauteur du pic \u00e9pid\u00e9mique.<br \/>\n<\/strong><\/em>Le projet vise \u00e0 estimer la courbe d\u2019\u00e9volution du nombre de cas\/admissions\/d\u00e9c\u00e8s \u00e0 l\u2019\u00e9chelle de pays\/r\u00e9gions. Plus particuli\u00e8rement, il s\u2019agit d\u2019avoir une capacit\u00e9 d\u2019anticipation sur la date et l\u2019ampleur du pic \u00e9pid\u00e9mique. L\u2019enjeu est d\u2019anticiper la mont\u00e9e en charge pour les services de sant\u00e9 et plus globalement pour les actions des pouvoirs publics. Les mod\u00e8les \u00e9pid\u00e9miologiques propos\u00e9s s\u2019appuient sur les statistiques publiques et la difficult\u00e9 principale rencontr\u00e9e pour la France r\u00e9sulte du peu de tests de d\u00e9pistage effectu\u00e9s.<\/p>\n<p><em><strong>II. Mod\u00e9lisation et simulation de ph\u00e9nom\u00e8nes \u00e9pid\u00e9miques, \u00e9valuation des strat\u00e9gies de contr\u00f4le.<\/strong><\/em><br \/>\nLe projet vise \u00e0 l\u2019\u00e9laboration d\u2019un cadre de simulation pour l\u2019\u00e9valuation des strat\u00e9gies de contr\u00f4le (quarantaine, confinement, traitement) en s\u2019appuyant sur des mod\u00e8les de propagation du virus \u00e0 des \u00e9chelles meso (e.g. r\u00e9seaux de contact \u00e0 l\u2019\u00e9chelle des individus ou de groupes d\u2019individus). Ces mod\u00e8les permettront de tester des sc\u00e9narios de mani\u00e8re stylis\u00e9e en l\u2019absence de donn\u00e9es fiables permettant de rendre compte des m\u00e9canismes de contamination.<\/p>\n<p><em><strong>III. Outil d\u2019aide \u00e0 la d\u00e9cision en p\u00e9riode d\u2019attrition des personnels d\u2019unit\u00e9s sanitaires ou sensibles en \u00e9pid\u00e9mie de COVID-19<\/strong><\/em><br \/>\nCe projet vise \u00e0 la mise en place d\u2019un outil d\u2019aide \u00e0 la d\u00e9cision pour les h\u00f4pitaux et autres unit\u00e9s sensibles soumis \u00e0 l\u2019attrition du personnel atteint par le COVID-19. L\u2019objectif est de produire des rapports journaliers permettant \u00e0 la fois de visualiser l\u2019\u00e9volution de l\u2019\u00e9pid\u00e9mie \u00e0 l\u2019\u00e9chelle de l\u2019unit\u00e9, mais aussi de proposer des projections \u00e0 quelques jours et enfin d\u2019\u00e9valuer a priori les sc\u00e9narios de red\u00e9ploiement des personnels ou de r\u00e9organisation interne.<\/p>\n<h5><strong>Quels sont les r\u00e9sultats d\u00e9j\u00e0 observ\u00e9s et quelles vont \u00eatre leurs applications\u00a0?<\/strong><\/h5>\n<p><em>\u00a0<\/em><strong> N. V.\u00a0: <\/strong>Le projet portant sur la <em>conception d\u2019un outil d\u2019aide \u00e0 la d\u00e9cision pour la gestion des personnels et l\u2019organisation des service d\u2019un h\u00f4pital<\/em> a pris corps en un temps record\u00a0: <em>un d\u00e9monstrateur est d\u2019ores et d\u00e9j\u00e0 d\u00e9ploy\u00e9 au sein d\u2019un h\u00f4pital de la r\u00e9gion parisienne<\/em> et il fournit un \u00e9tat journalier de l\u2019attrition des personnels soignants par service. Cliniciens, chercheurs en math\u00e9matiques appliqu\u00e9es et d\u00e9veloppeurs fournis par nos partenaires industriels ont r\u00e9alis\u00e9 un sprint et ont \u00e9labor\u00e9 une premi\u00e8re version de l\u2019outil en moins d\u2019une semaine. Ce projet va b\u00e9n\u00e9ficier d\u2019un financement de l\u2019AID pendant 18 mois, ce qui va permettre d\u2019enrichir le d\u00e9monstrateur, d\u2019accompagner d\u2019\u00e9ventuels autres sites pilotes souhaitant s\u2019approprier l\u2019outil, d\u00e9velopper des travaux de recherche dans le domaine de la mod\u00e9lisation et la simulation spatio-temporelle de la contagion sur un site. Tous les programmes informatiques aff\u00e9rents au projet seront mis \u00e0 disposition gratuitement et en open source.<\/p>\n<p style=\"text-align: left;\">Un autre projet qui a \u00e9galement donn\u00e9 lieu \u00e0 une r\u00e9alisation en moins d\u2019une semaine, est <strong><em>la r\u00e9alisation d\u2019un \u00e9tat de l\u2019art scientifique des mod\u00e8les \u00e9pid\u00e9miques<\/em> <\/strong>(compartimentaux, agents, etc.) propos\u00e9s sur le Covid-19. Une grille de synth\u00e8se a \u00e9t\u00e9 propos\u00e9e et permet de confronter les mod\u00e8les issus de diff\u00e9rents articles dans un cadre commun. Cet \u00e9tat de l\u2019art s\u2019enrichit chaque jour au fil des nouvelles publications et peut \u00eatre consult\u00e9 en ligne sur les adresses suivantes\u00a0:<br \/>\n<a href=\"https:\/\/github.com\/MyrtoLimnios\/covid19-biblio\">https:\/\/github.com\/MyrtoLimnios\/covid19-biblio<\/a><br \/>\n<a href=\"http:\/\/covidreview.org\/kibana\">http:\/\/covidreview.org\/kibana<br \/>\n<\/a><\/p>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Le Centre Borelli est membre de l\u2019Institut Cognition depuis f\u00e9vrier 2020. L\u2019Institut Cognition regroupe 22 Unit\u00e9s de Recherche publiques et a obtenu le label Carnot lors du 4\u00e8me Appel de l\u2019ANR. 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